Она была открыта 31 декабря 1964 года и названа по имени Северного речного вокзала на Химкинском водохранилище, который находится неподалеку от нее. 
Станция впервые появилась в планах 1957 года, которые затем неоднократно корректировались. Так, например, в плане 1960-го года предполагалось, что участок метрополитена «Завод Войкова»-«Водный стадион»-«Речной вокзал» будет наземным, однако позднее архитекторы вернулись к подземному варианту. До 1975 года «Речной вокзал» был самой северной станцией столичного метро.

Авторами проекта станции стали архитекторы Н.И. Демчинский и Ю.А. Колесникова. Оформление «Речного вокзала» минималистично – станция была построена в эпоху Никиты Сергеевича Хрущева, который боролся с «излишествами» в строительстве. Стены путей выложены белой и зеленой плиткой, пол платформы выложен серым гранитом, а колонны облицованы красно-коричневым мраморовидным известняком с прожилками кальцита. Кроме того, в отделке колонн в северной части платформы можно увидеть окаменелости – раковины аммонитов и наутилусов. 

В пешей доступности от метро располагаются главные достопримечательности Левобережного района – парк Дружбы, Северный речной вокзал с прилегающим парком и Храм иконы Божией Матери Знамение в Аксиньине.