Собрание музея насчитывает 300 000 единиц хранения. Это личные вещи, документы, журналы операций, медицинские инструменты и оборудование великих русских ученых медиков. Предметы, связанные с деятельностью ученых, ставших предтечами мировой трансплантологии. Посетители смогут увидеть первый аппарат искусственного кровообращения, первые пересадки искусственного сердца и сердечно-легочного комплекса собаке.

На выставке «100 лет народному комиссариату здравоохранения» представлены плакаты санитарного просвещения, кадры кинохроники, оборудование и инструменты, фотографии новаторских операций и патенты на изобретения.