Императрица Елизавета Петровна из тех редких послепетровских Романовых, которые любили Москву. При Анне Иоанновне, удаленная от двора, Елизавета Петровна жила в Покровском-Рубцово. По преданию – весело, устраивая праздники, танцы и гуляния. В 1737 г. деревянный дворец сгорел. В 1739 г. Елизавета построила новый на берегу пруда: одноэтажный, на высоком подклете, с центральным двусветным залом. Интерьеры дворца не сохранились, но известно, что они были отделаны в японском и китайском стилях. Роскошный парк с катальной горкой и каруселями был устроен в 1752 г. архитектором Б.-Ф. Растрелли. Он же делал и проект нового дворца, который не был осуществлён.
После смерти Елизаветы дворец практически не использовался. В 1872 г. территория была отдана Покровской общине сестёр милосердия. Община произвела переделки по проекту П.П. Скоморошенко: надстроили второй этаж, построили боковые крылья, изменили декор фасадов.
Общину закрыли в 1920-х гг., устроив в бывшем дворце огромные коммунальные квартиры, которые просуществовали здесь до 1980-х гг.
В настоящее время во дворце располагается Государственный научно-исследовательский институт реставрации.