В 1950 году между зданиями музея была построена теплица, в которой выращивались растения для опытов по ботанике. Биологический музей со дня своего основания стремился приобщать своих посетителей к научным методам и уделял много внимания демонстрации экспериментов. Физиология растений всегда была одной из самых любимых областей.
Сегодня в оранжерее растёт более 500 растений тропических и субтропических видов, а в саду при музее — более двухсот видов дикорастущих растений города, в том числе занесённые в красную книгу Москвы.