Музей наук о Земле Московского дворца пионеров располагает минералогической коллекцией. Сейчас она располагает более, чем 200 экспонатами, представляющими собой минералы из самых разных групп, драгоценными и поделочными камнями, изделиями из минералов, гальками и полированными срезами, а также формами минеральных агрегатов.

Другая часть музея – коллекция горных пород. Она включает в себя образцы магматических, осадочных и метаморфических горных пород, импактитов, коллекцию горючих ископаемых, а также палеонтологическую коллекцию.

Музей высоко оценен научным руководителем ЦЭО, профессором МГУ, доктором биологических наук, известным телеведущим Николаем Николаевичем Дроздовым.